Itä-Suomen yliopiston biolääketieteen yksikön akatemiatutkija Lu Chengille on myönnetty rahoitus Euroopan innovaationeuvoston (EIC) arvostetusta Pathfinder Open 2025 -hausta. Cheng toimii toisena vastuullisena johtajana RamanProSeq-hankkeessa, jonka tavoitteena on kehittää uudenlainen optinen teknologia yksittäisten proteiinimolekyylien sekvensointiin.
Kolmivuotinen hanke pyrkii kehittämään seuraavan sukupolven optista sekvensointiteknologiaa, jonka avulla on mahdollista lukea yksittäisiä proteiinimolekyylejä suoraan yhdistämällä plasmonista nanohuokosteknologiaa ja Raman-spektroskopiaa. Uudenlainen teknologia voi edistää merkittävästi proteiinien tutkimusta, sairauksien varhaista diagnostiikkaa sekä yksilöllistä lääketiedettä.
Erittäin kilpailtu rahoitus
Erittäin kilpaillussa haussa vain 2,1 prosenttia hakijoista sai rahoituksen. RamanProSeq-hankkeen kokonaisbudjetti on 3 miljoonaa euroa ja Itä-Suomen yliopiston osuus rahoituksesta on 264 000 euroa.
Hanketta koordinoi Oulun yliopisto. Hanketta toteututtaa kansainvälinen konsortio, johon Oulun yliopiston lisäksi kuuluvat Itä-Suomen yliopisto, portugalilainen Universidade NOVA de Lisboa, saksalainen RWTH Aachen University, italialainen Istituto Italiano di Tecnologia ja Nottingham Trent University Iso-Britanniassa.
Itä-Suomen yliopisto vastaa hankkeen algoritmikehityksestä
Itä-Suomen yliopistossa kehitetään Lu Chengin johdolla laskennallisia menetelmiä, joiden avulla nanohuokosjärjestelmästä saatavat Raman-spektrisignaalit tulkitaan aminohapposekvensseiksi.
– Rahoituksen avulla pystymme yhdistämään fysiikkaan perustuvaa mittaamista tekoälypohjaiseen biologisten signaalien tulkintaan. On innostavaa päästä edistämään teknologiaa, joka voi mullistaa proteiinitutkimusta ja lisätä ymmärrystä ihmisen sairauksista, Cheng sanoo.
Cheng yhdistää tutkimuksessaan koneoppimista, monisto-oppimista ja laajoja kielimalleja monimutkaisen biologisen datan tulkintaan. Itä-Suomen yliopistolla onkin hankkeessa keskeinen rooli data-analyysin ja algoritmi-innovaatioiden osalta.
Mahdollisuus mullistaa yksilöllistä lääketiedettä
RamanProSeq-konsortion tavoitteena on kehittää prototyyppi sekvensointialustasta, joka mahdollistaa yksittäisten proteiinien tunnistamisen tarkasti ilman merkkiaineita.Näin avautuu uusia mahdollisuuksia yksilölliselle lääketieteelle ja reaaliaikaiselle diagnostiikalle.
Euroopan innovaationeuvoston tiedote (englanniksi): EIC Pathfinder Open 2025 Results
